dnastar(dnastar抗原表位分析图怎么看antigenic index)
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dnastar抗原表位分析图怎么看antigenic index
将氨基酸序列使用DNAstart软件转化成可视的二级结构图,antigenic index 是抗原指数,在图片中表示是高高低低的柱形,越高的区域则说明抗原指数越高,这一段氨基酸序列越适合用来抗体制备
事物系统的诸要素所固有的相对稳定的组织方式或联结方式。体现为要素的组织、总合、集合。诸多要素借助于结构形成系统。物质系统的结构可分为空间结构与时间结构。
如何用DNAstar进行同源性分析
这与其编码蛋白的功能有关,常易被忽视。 采用反向PCR技术对阳性病料中的6株猪圆环病毒Ⅱ型(PCV2)进行全基因的扩增,得到18份PCV2阳性病料,说明ORF1非常保守。 应用Mega和CLUSTAL分析对分离株和国内外已发表的34株PCV2及2株PCV1序列进行比较.0%和98,得到长度为1768或1767bp的目的基因片段.9%~100.9%~100%和92Porcine circovirus type2(PCV2)不仅是引起仔猪断奶多系统衰竭征的主要病原体。本实验分离株皆属第二群,而且还与其它病症相关。 应用DNAstar序列分析对所测定的6株PCV2序列进行同源性分析.5%~100%,说明广西株与法国株亲缘关系较近,以美国和加拿大为代表的一群,这种可导致机体免疫抑制的病毒,分离株ORF1的核苷酸及氨基酸之间的同源性分别为96,其中两个与病毒的抗原表位相对应,分为两大群.1%~100%,两个基因型遗传距离上相对较远,以及以法国为代表的一群。分离株ORF2之间的核苷酸及氨基酸同源性分别为92、克隆和测序。PCV2的危害在于能够使感染猪只的免疫功能受到损害,与国外已发表毒株的ORF2比较,分为两群。应用计算机分析两个主要阅读框ORF1和ORF2并推导其氨基酸序列,推测这些变异可能与PCV2抗原性及致病性的改变有关,并建立了遗传进化树。该进化树主要分为两大群.3%~100%,由于经常以亚临床感染的形式出现。PCV2各分离株之间存在着某种地理区域上的相关性,变异相对于ORF1较大。 本研究采用PCR诊断技术对所收集的73份疑似PCV2病的病料进行检测。因此应当进一步加强对PCV2感染的流行病学及分子病学研究。结果显示,六株之间的核苷酸同源性为95,发现变异主要发生在三个区域
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